Die Spannungen zwischen den verschiedenen palästinensischen Gruppierungen bestanden weiterhin auf hohem Niveau. Sowohl die Sicherheitskräfte der Palästinensischen Autonomiebehörde (PA) im Westjordanland als auch die Sicherheitskräfte der Hamas und Milizen im Gazastreifen nahmen Hunderte von Mitgliedern oder Sympathisanten der jeweils rivalisierenden Gruppierungen willkürlich fest und hielten sie ohne Anklage oder Gerichtsverfahren in Gewahrsam.
Im Gazastreifen töteten Hamas-Sicherheitskräfte 24 Mitglieder bewaffneter Clans. Während der Militäroffensive, die israelische Sicherheitskräfte am 27. Dezember 2008 starteten, entführten die Hamas und Milizen politische Gegner und ehemalige Gefangene, denen sie vorwarfen, mit dem israelischen Geheimdienst kollaboriert zu haben.
Das Recht auf freie Meinungsäußerung war weiterhin stark eingeschränkt, sowohl im Westjordanland unter der Regierung der PA als auch im Gazastreifen unter der Führung der Hamas. Militärgerichte im Westjordanland und im Gazastreifen verurteilten neun Menschen zum Tode, Hinrichtungen fanden jedoch nicht statt. Bewaffnete palästinensische Gruppierungen im Gazastreifen griffen wahllos Städte und Dörfer im Süden Israels an und töteten sieben israelische sowie zwei palästinensische Zivilisten. Bewaffnete palästinensische Gruppierungen und Einzelpersonen aus den von Israel besetzten palästinensischen Gebieten im Westjordanland einschließlich Ost-Jerusalem töteten 16 israelische Zivilisten. (Stand: 31.12.2008)